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理學院歷史悠久，其前身是始建于1930年的交通大學科學學院，1937年更名為理學院，1994年西安交通大學重新恢復理學院。學院由數學、物理、化學三個基礎學科組成，設有信息與計算科學、數學與應用數學、應用物理學、光信息科學與技術、材料物理、應用化學6個本科專業。
在保持老學科已有方向的特色、優勢與領先水平的基礎上，力爭在更多方向上達到國際先進水平。以實施“面向21世紀教育振興行動計劃”為契機，著力培養和選聘一批青年專家和學科帶頭人，力爭使理學院成為承擔國家相關基礎研究的基地以及中西部地區高層次基礎理論人才的積聚地。
學院現有教職工249人，其中教授58人（含博士生導師33人），副教授69人，博士后流動人員9人，青年教師大都具有博士學位。教師中獲得國家政府特殊津貼人員21人，“長江學者”特聘教授2人，國家級教學名師1人，教育部“跨世紀/新世紀優秀人才”3人，各種省、校級人才11人。學院現有各類在校學生1520人，其中博士生178人，碩士生406人，本科生936人。截止到2005年的五年中，共培養博士生92人，各類碩士生382人，本科生862人。
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