理想的醫院設計應由工藝專業主導設計，甚至主導醫院的整個建設過程，同時醫院作為建筑物的實際使用方，自醫院建設伊始，就需要與工藝專業密切合作，提出使用需求，以實現切合自身特點的定制設計和建造，建筑師和機電設計師在此基礎上進行設計，才有可能設計出合格的醫院。

除了較少的醫院專業設計團隊有較高的醫院設計水平，目前的醫院主體建筑設計大多由建筑設計機構的建筑師主導，項目的關注重點過分向建筑造型和裝修效果傾斜，有些代建或總包項目，沒有醫療工藝特別是暖通空調相關的工藝設計，設計師甚至很難與醫院方有交流，主體建筑設計往往連一級或二級醫療流程的設計深度都達不到，更勿論三級醫療流程、工藝條件設計以及工藝成果設計。

作為必要的設計輸入條件的醫療工藝設計的缺失，導致醫院暖通空調在主體建筑設計階段存在大量預留、眾多專項和深化設計分包，這些預留和分包難以避免與主體建筑設計的沖突和后期實施不合理、實施困難等，醫院凈化空調設計即為其中之一。在目前的設計環境下，醫院凈化空調設計應盡可能做好與主體建筑設計的協同，包括但不限于主體建筑的空間、系統、技術性能等多方面、多專業的協同設計。

主體建筑設計承擔凈化空調設計：

設計師具有凈化空調的設計能力，或者至少具有凈化空調條件設計和造價把控等能力。

(1) 關于工藝條件的獲取和在設計文件中的表達

從甲方處獲取，或甲方授權（有往來文函或合約等）由醫院方、工藝設計方、暖通設計師和建筑師共同確定，并將房間名稱、潔凈區范圍、潔凈度級別、壓力要求、最小凈高、各專業主要設備占位、局部通風設備、大型醫療設備參數等工藝條件表達在公共底圖上。

(2) 凈化空調條件設計

主體建筑設計機構完成的凈化空調設計（簡稱一次設計），一般情況下，后續會由凈化空調專業公司進行深化設計（簡稱二次設計）。這就要求一次設計確定的各種條件，如供電、上下水、空調冷熱水供應、加濕蒸汽供應、結構承重、室外機設置場地、凈化空調和通風機房、新風口、排風口、豎向井道、水平管道敷設空間等具有后續二次設計、實施及使用的合規性、可行性及合理性。

(3) 造價控制

一次設計所確定的凈化空調設計標準、空調系統形式、自動控制要求、設備備用情況等的正確性和設計完成度，是造價控制的基礎，將直接影響潔凈區的建設進程和建設質量。

(4) 凈化空調系統冷熱源設置

凈化空調系統的冷熱量需要根據潔凈區域在建筑中的分布、使用時間、使用性質等因素分別計算和統計。

凈化空調冷熱源系統（簡稱小系統）需根據各區域的使用要求和冷熱量需求的大小，確定并入主體建筑冷熱源系統（簡稱大系統），還是設置獨立的小系統。如果小系統與大系統合用，需要考慮冷熱需求不同步以及過渡季節小負荷時，供冷或供熱的可行性和經濟性。獨立設置的小系統，宜考慮適當的冗余量或有其他系統作為備用，使其具備與潔凈區對冷熱供應要求相適應的保障能力。